Koyomi Araragi menghabiskan tahun terakhirnya di sekolah menengah atas untuk membantu para gadis di kotanya mengatasi berbagai penderitaan supernatural. Namun sekarang Araragi telah berangkat ke universitas, meninggalkan teman-temannya untuk berjuang sendiri melawan masalah baru dan kutukan yang mengganggu mereka. Yotsugi Ononoki, yang dulunya adalah mayat manusia dan sekarang menjadi boneka hidup, tinggal di rumah Araragi, menjaga adiknya Tsukihi, seorang gadis yang menyimpan rahasia mistisnya sendiri. Sebagai bagian dari tugasnya, Yotsugi mengisi peran Araragi yang kosong sebagai ahli gaib, membantu orang lain di kota dengan masalah mereka.
Salah satu dari gadis-gadis ini, siswa sekolah menengah Nadeko Sengoku, perlahan-lahan pulih dari pengalamannya dengan paranormal. Dia menghindari kembali ke sekolah, dan lebih memilih untuk menghabiskan waktu sendirian di kamarnya dan mengejar mimpinya untuk menjadi seniman manga profesional. Untuk mempercepat pencarian Nadeko dalam menguasai keahliannya, Yotsugi meyakinkannya untuk membuat empat salinan dirinya, yang masing-masing mewakili aspek yang berbeda dari kepribadian Nadeko. Namun, klon-klon tersebut menolak untuk membantu Nadeko, malah melarikan diri ke kota dan menciptakan kekacauan. Sekarang dipaksa untuk bergulat dengan rasa identitasnya yang retak, Nadeko bertekad untuk menangkap mereka dan menyelesaikan konflik batinnya.