Jougorou Kobato memiliki kebiasaan untuk melibatkan diri ke dalam masalah orang lain. Setelah menyadari bahwa kemampuan detektifnya tidak diinginkan atau dihargai, dia membuat kesepakatan dengan temannya yang pemalu, Yuki Osanai, untuk menjadi orang biasa bersama-sama. Sekarang memasuki sekolah menengah atas, mereka bertujuan untuk dianggap sebagai orang biasa, namun Kobato tidak bisa tidak kembali ke cara deduktifnya saat dihadapkan dengan misteri sehari-hari.
Sayangnya, tidak semua kejadian biasa yang mereka temui. Ketika mereka menjalani hari-hari sekolah mereka dengan berusaha menghindari menarik perhatian, Kobato dan Osanai terkadang terjebak dalam insiden yang membuat rencana mereka untuk menjalani kehidupan yang damai dan biasa-biasa saja menjadi beresiko.
